修改HIR 接收影像
continuous-integration/drone/push Build is passing
Details
continuous-integration/drone/push Build is passing
Details
parent
b95cc97f55
commit
72d7136f1c
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@ -473,199 +473,216 @@ namespace IRaCIS.Core.SCP.Service
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var dicomFile = DicomFile.Open(ms);
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var dicomFile = DicomFile.Open(ms);
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var pixelData = DicomPixelData.Create(dicomFile.Dataset);
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var pixelData = DicomPixelData.Create(dicomFile.Dataset);
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var syntax = pixelData.Syntax;
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// 每个 fragment 固定大小 (64KB 示例，可以自己调整)
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if (pixelData != null)
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int fragmentSize = 20 * 1024;
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//var numberOfFrames = dicomFile.Dataset.GetSingleValueOrDefault(DicomTag.NumberOfFrames, 1);
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var frag = dicomFile.Dataset.GetDicomItem<DicomOtherByteFragment>(DicomTag.PixelData);
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int fragmentCount = frag?.Fragments?.Count()??0;
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var originOffsetTable = frag?.OffsetTable; //有可能没有表，需要自己重建
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var bot = new List<uint>();
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uint botOffset = 0;
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//需要拆成固定片段的
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if (syntax.IsEncapsulated && fragmentCount == pixelData.NumberOfFrames)
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{
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{
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try
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var newFragments = new DicomOtherByteFragment(DicomTag.PixelData);
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#region test
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//var newDicomFile = dicomFile.Clone();
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//var newDataset = newDicomFile.Dataset;
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//var dstPd = DicomPixelData.Create(newDataset, true);
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//for (int i = 0; i < pixelData.NumberOfFrames; i++)
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//{
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// var frame = pixelData.GetFrame(i);
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// dstPd.AddFrame(frame);
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// var data = frame.Data;
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// int offset = 0;
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// while (offset < data.Length)
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// {
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// int size = Math.Min(fragmentSize, data.Length - offset);
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// var buffer = new byte[size];
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// Buffer.BlockCopy(data, offset, buffer, 0, size);
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// newFragments.Fragments.Add(new MemoryByteBuffer(buffer));
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// offset += size;
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// }
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//}
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//var newOffsetTable = newDataset.GetDicomItem<DicomOtherByteFragment>(DicomTag.PixelData).OffsetTable;
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//newFragments.OffsetTable.AddRange(newOffsetTable.ToArray());
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#endregion
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#region test fo-dicom auto bot
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//var newDicomFile = dicomFile.Clone();
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//var newDataset = newDicomFile.Dataset;
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//var dstPd = DicomPixelData.Create(newDataset, true);
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//for (int i = 0; i < pixelData.NumberOfFrames; i++)
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//{
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// var frame = pixelData.GetFrame(i);
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// dstPd.AddFrame(frame);
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//}
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//var newOffsetTable = newDataset.GetDicomItem<DicomOtherByteFragment>(DicomTag.PixelData).OffsetTable;
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//Console.WriteLine(newOffsetTable.ToJsonStr());
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#endregion
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#region 暂时废弃
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for (int n = 0; n < pixelData.NumberOfFrames; n++)
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{
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{
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var frameData = pixelData.GetFrame(n); // 获取完整一帧
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var data = frameData.Data;
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int offset = 0;
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bot.Add(botOffset);
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botOffset += (uint)data.Length;
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while (offset < data.Length)
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var syntax = pixelData.Syntax;
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// 每个 fragment 固定大小 (64KB 示例，可以自己调整)
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int fragmentSize = 20 * 1024;
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//var numberOfFrames = dicomFile.Dataset.GetSingleValueOrDefault(DicomTag.NumberOfFrames, 1);
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var frag = dicomFile.Dataset.GetDicomItem<DicomOtherByteFragment>(DicomTag.PixelData);
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int fragmentCount = frag?.Fragments?.Count() ?? 0;
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var originOffsetTable = frag?.OffsetTable; //有可能没有表，需要自己重建
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var bot = new List<uint>();
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uint botOffset = 0;
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//需要拆成固定片段的
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if (syntax.IsEncapsulated && fragmentCount == pixelData.NumberOfFrames)
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{
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{
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botOffset += 8;
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int size = Math.Min(fragmentSize, data.Length - offset);
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var buffer = new byte[size];
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Buffer.BlockCopy(data, offset, buffer, 0, size);
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newFragments.Fragments.Add(new MemoryByteBuffer(buffer));
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var newFragments = new DicomOtherByteFragment(DicomTag.PixelData);
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offset += size;
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#region test
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//var newDicomFile = dicomFile.Clone();
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//var newDataset = newDicomFile.Dataset;
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//var dstPd = DicomPixelData.Create(newDataset, true);
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//for (int i = 0; i < pixelData.NumberOfFrames; i++)
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//{
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// var frame = pixelData.GetFrame(i);
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// dstPd.AddFrame(frame);
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// var data = frame.Data;
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// int offset = 0;
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// while (offset < data.Length)
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// {
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// int size = Math.Min(fragmentSize, data.Length - offset);
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// var buffer = new byte[size];
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// Buffer.BlockCopy(data, offset, buffer, 0, size);
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// newFragments.Fragments.Add(new MemoryByteBuffer(buffer));
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// offset += size;
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// }
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//}
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|
//var newOffsetTable = newDataset.GetDicomItem<DicomOtherByteFragment>(DicomTag.PixelData).OffsetTable;
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|
//newFragments.OffsetTable.AddRange(newOffsetTable.ToArray());
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||||||
|
#endregion
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#region test fo-dicom auto bot
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//var newDicomFile = dicomFile.Clone();
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//var newDataset = newDicomFile.Dataset;
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|
//var dstPd = DicomPixelData.Create(newDataset, true);
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//for (int i = 0; i < pixelData.NumberOfFrames; i++)
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//{
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// var frame = pixelData.GetFrame(i);
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// dstPd.AddFrame(frame);
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|
//}
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|
//var newOffsetTable = newDataset.GetDicomItem<DicomOtherByteFragment>(DicomTag.PixelData).OffsetTable;
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|
//Console.WriteLine(newOffsetTable.ToJsonStr());
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|
#endregion
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#region 暂时废弃
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for (int n = 0; n < pixelData.NumberOfFrames; n++)
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{
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var frameData = pixelData.GetFrame(n); // 获取完整一帧
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var data = frameData.Data;
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int offset = 0;
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bot.Add(botOffset);
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botOffset += (uint)data.Length;
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while (offset < data.Length)
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{
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botOffset += 8;
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|
int size = Math.Min(fragmentSize, data.Length - offset);
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|
var buffer = new byte[size];
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||||||
|
Buffer.BlockCopy(data, offset, buffer, 0, size);
|
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|
newFragments.Fragments.Add(new MemoryByteBuffer(buffer));
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offset += size;
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}
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|
}
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//保留原始偏移表
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if (originOffsetTable.Count == pixelData.NumberOfFrames)
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{
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newFragments.OffsetTable.AddRange(originOffsetTable.ToArray());
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|
}
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|
else
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|
{
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||||||
|
newFragments.OffsetTable.AddRange(bot.ToArray());
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||||||
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|
//Console.WriteLine(bot.ToJsonStr());
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|
}
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#endregion
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dicomFile.Dataset.AddOrUpdate(newFragments);
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// 重新保存 dicom 到流
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ms.SetLength(0);
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|
dicomFile.Save(ms);
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}
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}
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}
|
//传递过来的就是拆分的，但是是没有偏移表的，我需要自己创建偏移表，不然生成缩略图失败
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else if (syntax.IsEncapsulated && fragmentCount > pixelData.NumberOfFrames && originOffsetTable.Count == 0)
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||||||
//保留原始偏移表
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if (originOffsetTable.Count == pixelData.NumberOfFrames)
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{
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newFragments.OffsetTable.AddRange(originOffsetTable.ToArray());
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||||||
|
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}
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else
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{
|
|
||||||
newFragments.OffsetTable.AddRange(bot.ToArray());
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//Console.WriteLine(bot.ToJsonStr());
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}
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#endregion
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dicomFile.Dataset.AddOrUpdate(newFragments);
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// 重新保存 dicom 到流
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ms.SetLength(0);
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dicomFile.Save(ms);
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}
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||||||
//传递过来的就是拆分的，但是是没有偏移表的，我需要自己创建偏移表，不然生成缩略图失败
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else if (syntax.IsEncapsulated && fragmentCount > pixelData.NumberOfFrames && originOffsetTable.Count == 0)
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{
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||||||
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||||||
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uint offset = 0;
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bot.Add(offset);
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||||||
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||||||
var fistSize = frag.Fragments.FirstOrDefault()?.Size ?? 0;
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||||||
//和上一个大小不一样
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||||||
var isDiffrentBefore = false;
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||||||
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uint count = 0;
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||||||
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||||||
// 假设你知道每帧对应的 fragment 数量
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||||||
foreach (var frameFragments in frag.Fragments)
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||||||
{
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||||||
count++;
|
|
||||||
|
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||||||
if (frameFragments.Size == fistSize)
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||||||
{
|
{
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||||||
isDiffrentBefore = false;
|
|
||||||
// 累加这一帧所有 fragment 的大小
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offset += (uint)frameFragments.Size;
|
|
||||||
continue;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
else
|
|
||||||
{
|
|
||||||
offset += (uint)frameFragments.Size;
|
|
||||||
isDiffrentBefore = true;
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
if (isDiffrentBefore)
|
|
||||||
{
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uint offset = 0;
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||||||
//每个Fragment 也占用字节
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||||||
offset += 8 * count;
|
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||||||
bot.Add(offset);
|
bot.Add(offset);
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||||||
count = 0;
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|
||||||
|
var fistSize = frag.Fragments.FirstOrDefault()?.Size ?? 0;
|
||||||
|
|
||||||
|
//和上一个大小不一样
|
||||||
|
var isDiffrentBefore = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
uint count = 0;
|
||||||
|
|
||||||
|
// 假设你知道每帧对应的 fragment 数量
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||||||
|
foreach (var frameFragments in frag.Fragments)
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||||||
|
{
|
||||||
|
count++;
|
||||||
|
|
||||||
|
if (frameFragments.Size == fistSize)
|
||||||
|
{
|
||||||
|
isDiffrentBefore = false;
|
||||||
|
// 累加这一帧所有 fragment 的大小
|
||||||
|
offset += (uint)frameFragments.Size;
|
||||||
|
continue;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
offset += (uint)frameFragments.Size;
|
||||||
|
isDiffrentBefore = true;
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
if (isDiffrentBefore)
|
||||||
|
{
|
||||||
|
//每个Fragment 也占用字节
|
||||||
|
offset += 8 * count;
|
||||||
|
bot.Add(offset);
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||||||
|
count = 0;
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||||||
|
|
||||||
|
}
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||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
bot.RemoveAt(bot.Count - 1);
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||||||
|
// 设置到新的 PixelData
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|
frag.OffsetTable.AddRange(bot.ToArray());
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
// 重新保存 DICOM 到流
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||||||
|
ms.SetLength(0);
|
||||||
|
dicomFile.Save(ms);
|
||||||
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
catch (Exception mutiEx)
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||||||
bot.RemoveAt(bot.Count - 1);
|
{
|
||||||
// 设置到新的 PixelData
|
Log.Logger.Warning($"CallingAE:{Association.CallingAE} CalledAE:{Association.CalledAE} 处理多帧失败，上传原始文件：{mutiEx.ToString()}");
|
||||||
frag.OffsetTable.AddRange(bot.ToArray());
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
// 重新保存 DICOM 到流
|
|
||||||
ms.SetLength(0);
|
|
||||||
dicomFile.Save(ms);
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
}
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||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
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||||||
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||||||
|
|
||||||
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#endregion
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#endregion
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Reference in New Issue